Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSL3PQ5NE16 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSL3PQ5NE16 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms