Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms