Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNDC3AQ59EK9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3AQ59EK9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms