Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSD17B12Q53GQ0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSD17B12Q53GQ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms