Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP55Q53EZ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms