Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYTL3Q4VX76 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms