Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC153Q494R4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC153Q494R4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms