Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRFIP1Q32MZ4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms