Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL38Q2WGJ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms