Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC57Q2TAC2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC57Q2TAC2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC57Q2TAC2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms