Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC96Q2M329 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC96Q2M329 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC96Q2M329 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms