Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSMPQ1L6U9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSMPQ1L6U9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms