Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDO1Q16878 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms