Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA3Q16787 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA3Q16787 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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