Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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PCSK7Q16549 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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PCSK7Q16549 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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PCSK7Q16549 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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PCSK7Q16549 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCSK7Q16549 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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