Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKN1Q16512 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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