Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA6Q15825 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA6Q15825 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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