Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM1Q15629 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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TRAM1Q15629 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAM1Q15629 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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