Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3A2Q15428 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3A2Q15428 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3A2Q15428 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms