Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUM3Q15397 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PUM3Q15397 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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