Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3CQ15386 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
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UBE3CQ15386 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3CQ15386 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
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