Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTF1Q15361 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTF1Q15361 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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