Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRRQ15256 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms