Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHPRHQ149N8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHPRHQ149N8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
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