Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCARF1Q14162 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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