Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE1CQ14123 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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