Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBFBQ13951 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CBFBQ13951 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CBFBQ13951 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CBFBQ13951 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBFBQ13951 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBFBQ13951 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBFBQ13951 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBFBQ13951 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBFBQ13951 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBFBQ13951 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBFBQ13951 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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