Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
SHROOM2Q13796 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SHROOM2Q13796 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SHROOM2Q13796 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms