Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNA1SQ13698 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNA1SQ13698 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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