Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL1Q13616 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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