Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXE3Q13461 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXE3Q13461 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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