Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRSQ13332 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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PTPRSQ13332 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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PTPRSQ13332 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRSQ13332 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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