Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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SCGB2A2Q13296 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCGB2A2Q13296 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCGB2A2Q13296 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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