Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF5Q13243 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
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