Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1H3Q13133 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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