Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP4Q13115 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP4Q13115 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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