Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHAF1AQ13111 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHAF1AQ13111 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHAF1AQ13111 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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