Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
PRDM2Q13029 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PRDM2Q13029 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRDM2Q13029 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PRDM2Q13029 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
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