Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4Q12950 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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