Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXC1Q12948 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms