Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB40BQ12829 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB40BQ12829 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB40BQ12829 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB40BQ12829 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB40BQ12829 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB40BQ12829 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB40BQ12829 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB40BQ12829 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB40BQ12829 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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RAB40BQ12829 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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RAB40BQ12829 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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RAB40BQ12829 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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RAB40BQ12829 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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RAB40BQ12829 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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RAB40BQ12829 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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RAB40BQ12829 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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RAB40BQ12829 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB40BQ12829 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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