Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TROAPQ12815 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TROAPQ12815 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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