Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNH2Q12809 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNH2Q12809 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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