Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 URA4YLR420W 1095 nt4.03□□□□□ -1.76
SPE4Q12455 PML39YML107C 1005 nt4.03□□□□□ -1.76
SPE4Q12455 TMC1YOR052C 453 nt4.03□□□□□ -1.76
SPE4Q12455 YBR013CYBR013C 390 nt4.03□□□□□ -1.76
SPE4Q12455 YPR174CYPR174C 666 nt4.03□□□□□ -1.76
SPE4Q12455 FOX2YKR009C 2703 nt4.03□□□□□ -1.76
SPE4Q12455 ECM22YLR228C 2445 nt4.03□□□□□ -1.76
SPE4Q12455 MAK11YKL021C 1407 nt4.03□□□□□ -1.76
SPE4Q12455 MNR2YKL064W 2910 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 ALO1YML086C 1581 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YGR026WYGR026W 837 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YNL035CYNL035C 1170 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YNR071CYNR071C 1029 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 UTP23YOR004W 765 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 PNO1YOR145C 825 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 SYC1YOR179C 567 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YOR263CYOR263C 408 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 RPS11BYBR048W 471 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 ICS2YBR157C 768 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 CDC14YFR028C 1656 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 RPB2YOR151C 3675 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 PUB1YNL016W 1362 nt4.02□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YOR365CYOR365C 2112 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 AZR1YGR224W 1842 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 RXT3YDL076C 885 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 RAD55YDR076W 1221 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 PIB1YDR313C 861 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 RRP17YDR412W 708 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 UBC8YEL012W 657 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YOS1YER074W-A 258 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 HTD2YHR067W 843 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YKL162CYKL162C 1209 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 UBC12YLR306W 567 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 SWC7YLR385C 399 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 IRC13YOR235W 315 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 TIF5YPR041W 1218 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 RRP7YCL031C 894 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YBR238CYBR238C 2196 nt4.01□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 MTH1YDR277C 1302 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 NHP10YDL002C 612 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 HAT2YEL056W 1206 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YGL132WYGL132W 336 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YGL138CYGL138C 1038 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 GAT3YLR013W 426 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YLR169WYLR169W 354 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YNL226WYNL226W 411 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 RPC34YNR003C 954 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YOR186WYOR186W 435 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 CAF20YOR276W 486 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 FLC1YPL221W 2382 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 PLM2YDR501W 1566 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 MSS4YDR208W 2340 nt4□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 SDS23YGL056C 1584 nt3.99□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 CPR1YDR155C 489 nt3.99□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 KRE28YDR532C 1158 nt3.99□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 IRC25YLR021W 540 nt3.99□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 NRK1YNL129W 723 nt3.99□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YOR131CYOR131C 657 nt3.99□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 SLX1YBR228W 915 nt3.99□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 POF1YCL047C 777 nt3.99□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YML020WYML020W 1995 nt3.99□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 MLH2YLR035C 2088 nt3.99□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 MTC4YBR255W 2085 nt3.99□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 RNA14YMR061W 2034 nt3.99□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 SSB1YDL229W 1842 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 PRP3YDR473C 1410 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 CET1YPL228W 1650 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 HSP30YCR021C 999 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 DPB4YDR121W 591 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YER076CYER076C 909 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 SPT15YER148W 723 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 SPI1YER150W 447 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 PRP18YGR006W 756 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YHI9YHR029C 885 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 BOS1YLR078C 735 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 GPN3YLR243W 819 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 COS1YNL336W 1146 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 MDM12YOL009C 816 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 CCL1YPR025C 1182 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YBR292CYBR292C 372 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 DIP2YLR129W 2832 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 NAT1YDL040C 2565 nt3.98□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 DBP3YGL078C 1572 nt3.97□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 TDA6YPR157W 1404 nt3.97□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 GSM1YJL103C 1857 nt3.97□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 PFS1YHR185C 714 nt3.97□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 RSM25YIL093C 795 nt3.97□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YLR365WYLR365W 333 nt3.97□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 RPL15BYMR121C 615 nt3.97□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 DUG3YNL191W 1074 nt3.97□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 REX4YOL080C 870 nt3.97□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 IDI1YPL117C 867 nt3.97□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 MRPL51YPR100W 423 nt3.97□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 NUP133YKR082W 3474 nt3.97□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 YTM1YOR272W 1383 nt3.97□□□□□ -1.77
SPE4Q12455 SEC2YNL272C 2280 nt3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.6 ms