Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 YKL102CYKL102C 306 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YLR125WYLR125W 411 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 SWS2YNL081C 432 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 RRT16YNL105W 429 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 COQ10YOL008W 624 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YRO2YBR054W 1035 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 PPN1YDR452W 2025 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 ARP9YMR033W 1404 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 TAX4YJL083W 1815 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 CEX1YOR112W 2286 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 ERG11YHR007C 1593 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 MSS1YMR023C 1581 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 MOT2YER068W 1764 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YRB30YGL164C 1323 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 KEX2YNL238W 2445 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 SAC6YDR129C 1929 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YCL068CYCL068C 783 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 AHP1YLR109W 531 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 SEC13YLR208W 894 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 ADI1YMR009W 540 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YPL225WYPL225W 441 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 MCM16YPR046W 546 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 MRH4YGL064C 1686 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 ADA2YDR448W 1305 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 CUE2YKL090W 1332 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 STE13YOR219C 2796 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 COX15YER141W 1461 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 AAD3YCR107W 1092 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 SLD5YDR489W 885 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 RPL7AYGL076C 735 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 LSB1YGR136W 726 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YLR463CYLR463C 552 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 MSN1YOL116W 1149 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 RPA43YOR340C 981 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 RPL7BYPL198W 735 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 RIX7YLL034C 2514 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 OCT1YKL134C 2319 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 MPH2YDL247W 1830 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YPL109CYPL109C 1974 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 SFB3YHR098C 2790 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 PYC2YBR218C 3543 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 PBP4YDL053C 558 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YDL163WYDL163W 303 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YDR491CYDR491C 492 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 LIF1YGL090W 1266 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 ZRT1YGL255W 1131 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 MTC2YKL098W 1074 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 VPS51YKR020W 495 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 TIF11YMR260C 462 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 SHP1YBL058W 1272 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 CMD1YBR109C 444 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 LDB19YOR322C 2457 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 JIP5YPR169W 1479 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YCT1YLL055W 1596 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 ERG4YGL012W 1422 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YDR149CYDR149C 708 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 PRP45YAL032C 1140 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 AIM32YML050W 936 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YPR170CYPR170C 336 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 SMX3YPR182W 261 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 ALD6YPL061W 1503 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 SRP1YNL189W 1629 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 PRY3YJL078C 2646 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 HCM1YCR065W 1695 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 RTT105YER104W 627 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 DBP8YHR169W 1296 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 JLP2YMR132C 627 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YOR186WYOR186W 435 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 CNE1YAL058W 1509 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 MMT1YMR177W 1533 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 NGL2YMR285C 1548 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 HSP104YLL026W 2727 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 PSY4YBL046W 1326 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 BUD7YOR299W 2241 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 RPA14YDR156W 414 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 RSM24YDR175C 960 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YGL039WYGL039W 1047 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 MIC26YGR235C 702 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 QCR10YHR001W-A 234 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 DCS1YLR270W 1053 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 RKI1YOR095C 777 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 TPK2YPL203W 1143 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 RPN7YPR108W 1290 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YBR232CYBR232C 360 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 HXT15YDL245C 1704 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 HXT16YJR158W 1704 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 HIR1YBL008W 2523 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 GEX2YKR106W 1848 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 MCM6YGL201C 3054 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YEL020CYEL020C 1683 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YKR078WYKR078W 1758 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YDL012CYDL012C 324 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 SEC20YDR498C 1152 nt5.49□□□□□ -1.53
TY1A-DR3Q12441 YER135CYER135C 393 nt5.49□□□□□ -1.53
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