Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 UBP9YER098W 2265 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 NHP2YDL208W 471 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 TVP15YDR100W 432 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YER010CYER010C 705 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YER084WYER084W 387 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YML6YML025C 861 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 APD1YBR151W 951 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 BIK1YCL029C 1323 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YGR054WYGR054W 1929 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 ARE2YNR019W 1929 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YDR131CYDR131C 1671 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 FMN1YDR236C 657 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 PDX1YGR193C 1233 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YHI9YHR029C 885 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YJR020WYJR020W 333 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 RPL17AYKL180W 555 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 TAF9YMR236W 474 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YGK3YOL128C 1128 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 ERG11YHR007C 1593 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 CCT8YJL008C 1707 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 NOP56YLR197W 1515 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 PGM1YKL127W 1713 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YML133CYML133C 4125 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 RSM24YDR175C 960 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YDR413CYDR413C 576 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 VMA3YEL027W 483 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 PRP45YAL032C 1140 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YKT6YKL196C 603 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 CPR3YML078W 549 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 TEL2YGR099W 2067 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 HXK2YGL253W 1461 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 PFK2YMR205C 2880 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 RAD28YDR030C 1521 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YIL055CYIL055C 1884 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 SWT1YOR166C 1377 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 CDC12YHR107C 1224 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 LYS1YIR034C 1122 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 MRPL20YKR085C 588 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YLR462WYLR462W 609 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 COQ5YML110C 924 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YMR315WYMR315W 1050 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 MRPS18YNL306W 654 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 MSN1YOL116W 1149 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YPL035CYPL035C 348 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YPR202WYPR202W 717 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 ERV15YBR210W 429 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 PPN1YDR452W 2025 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 PKP2YGL059W 1476 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YKL075CYKL075C 1353 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 AFR1YDR085C 1863 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 COX9YDL067C 180 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 NCB2YDR397C 441 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 GCG1YER163C 699 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YFL051CYFL051C 483 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 MIG2YGL209W 1149 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 RMR1YGL250W 726 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 SPL2YHR136C 447 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YJR079WYJR079W 330 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 TPM1YNL079C 600 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 CMR3YPR013C 954 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 GLN1YPR035W 1113 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 ILV6YCL009C 930 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 NTE1YML059C 5040 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 XKS1YGR194C 1803 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 POP1YNL221C 2628 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 NAM9YNL137C 1461 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 HXT15YDL245C 1704 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 HXT16YJR158W 1704 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YKR078WYKR078W 1758 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YDL187CYDL187C 330 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YDR396WYDR396W 501 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 FAR7YFR008W 666 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 PFD1YJL179W 330 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YKL177WYKL177W 339 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 RNH203YLR154C 333 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YNL170WYNL170W 396 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YOR277CYOR277C 309 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 ADF1YCL058W-A 342 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 NMD3YHR170W 1557 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 MUD2YKL074C 1584 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 NGG1YDR176W 2109 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 TRE2YOR256C 2430 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 BNA5YLR231C 1362 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 RGD1YBR260C 2001 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 BUD27YFL023W 2391 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YDL163WYDL163W 303 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 OM45YIL136W 1182 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 YJL175WYJL175W 513 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 MAK16YAL025C 921 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-BLQ12266 UNG1YML021C 1080 nt5.65□□□□□ -1.5
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