Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPSF1Q10570 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
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