Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD3Q0VAK6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms