Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTN3Q08043 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms