Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK18Q07002 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms